نظریه تحریف کتاب مقدس معتقد است که شاگردان مسیح، انجیل را تحریف کرده اند. اما قرآن چنین ادعایی را تایید نمی کند:”خداوند پشتیبان حواریون بوده است، زیرا آنان یاران خداوند بودند” (سوره صف آیه ۱۴).
نظریه تحریف می گوید کتاب مقدس قرن ها یا هزاران سال قبل از ظهور اسلام تحریف شده، قرآن می گوید که به پیامبر اسلام و یهودیان و مسیحیان توصیه شد کتاب مقدس را بخوانند (سوره یونس آیه ۹۴- ۹۵، سوره مائده آیات ۱۵ و ۴۶، سوره انعام آیه ۹۲، سوره نساء آیه ۱۳۶)
نظریه تحریف می گوید مسیحیان و یهودیان کتاب مقدس را تحریف کردند، قرآن می گوید هیچکس کلام خدا را نمی تواند تغییر دهد (انعام آیه ۱۱۵، یونس آیه ۶۴ و کهف آیه ۲۷).
نظریه تحریف می گوید که بعد از ظهور اسلام کتاب مقدس باطل شد، قرآن هرگز پیشگویی نکرد کتاب مقدس باطل و منسوخ خواهد شد، و حتی هشدار داد کسانی که کتاب مقدس را رد کنند، مورد غضب خداوند قرار خواهند گرفت (سوره مائده آیه ۱۳۶).
بنابراین قرآن نه فقط ادعا نمی کند که تورات و انجیل تحریف شده اند، بلکه اطاعت از کتاب مقدس را برای یهودیان و مسیحیان الزامی و واجب می داند.